概况

2021-至今    深圳湾实验室  资深研究员

2013-至今    清华大学深圳国际研究生院  教授

2007-2021    新加坡国立大学药学系  教授

2004-2005    新加坡国立大学计算科学系  主任

1997-2005    新加坡国立大学计算科学系  助理教授，副教授

1997             美国ISIS制药公司  科学家

1996-1997    美国Toledo大学物理系  访问助理教授

1989-1996    美国普渡大学  博士后

1985-1989    英国曼彻斯特大学数学系 理论物理专业  博士

1982-1985    中科院理论物理所  硕士

1978-1982    大连理工大学应用物理系  学士

研究领域

1. 人工智能在生物医药领域的应用

2. 生物信息学

3. 计算机辅助药物设计

4. 科学与艺术（蛋白质美术，音乐)

主要学术成就

• 发明了反向对接靶点发现方法

• 创建了国际医药领域知名的TTD药靶数据库

• 创建了全球首个科研类中药数据库，天然产物定量活性数据库，功能植物综合活性数据库

• 开创性的应用系统生物学原理分析西药及草药的协同作用机理

• 首次揭示了产药物种在生物进化空间的扎堆规律

• 创新性的应用AI+生物信息学方法和中西药对比方法阐明中药治疗新冠肺炎的机理

• 国际上首批学者将AI引进生物和药物研究

• 发展了AI开箱即用深度学习药物筛选新方法

• 国际上首批创作蛋白质音乐和蛋白质美术作品

• 应用AI创作蛋白质美术作品

代表性论文

H指数 50 (SCI),  52 (Scopus), 53 (Research Gate), 63 (Google Scholar) ,总引  9141 (SCI), 9967 (Scopus), 10,157 (Research Gate), 15,681 (Google Scholar)。

以通讯作者在Nature Biotechnology（影响因子35）, Nature Review Drug Discovery（影响因子50）, Nature Machine Inteligence, Pharmacological Review（影响因子18）, Trends in Pharmacological Sciences (影响因子12), PNAS（影响因子9）, Cancer Research（影响因子9）, Natural Product Reports (影响因子11）,  Nucleic Acids Research（影响因子11）等杂志发表240多篇文章。

1. Shen, Wanxiang;  Zeng, Xian;  Zhu, Feng;  Wang, Yali;  Qin, Chu;  Tan, Ying;  Jiang, Yuyang*; Chen, Yuzong*, Out-of-the-box deep learning prediction of pharmaceutical properties by broadly learned knowledge-based molecular representations. Nat. Mach. Intell., 2021, 3 (4), 334-343.

2. Li, Yinghong;  Li, Xiaoxu;  Hong, Jiajun;  Wang, Yunxia;  Fu, Jianbo;  Yang, Hong;  Yu, Chunyan;  Li, Fengcheng;  Hu, Jie;  Xue, Weiwei;  Jiang, Yuyang;  Chen, Yuzong*; Zhu, Feng*, Clinical trials, progression-speed differentiating features and swiftness rule of the innovative targets of first-in-class drugs. Briefings in Bioinformatics, 2020, 21 (2), 649-662.

3. Zeng, Xian;  Zhang, Peng;  Wang, Yali;  Qin, Chu;  Chen, Shangying;  He, Weidong;  Tao, Lin;  Tan, Ying;  Gao, Dan;  Wang, Bohua;  Chen, Zhe;  Chen, Weiping*;  Jiang, Yuyang*; Chen, Yuzong*, CMAUP: a database of collective molecular activities of useful plants. Nucleic Acids Research, 2019, 47 (D1), D1118-D1127.

4. Feng Zhu, Xiaoxu Li, Shengyong Yang, Yuzong Chen*. Clinical Success of Drug Targets Prospectively Predicted by In Silico Study. Trends Pharmacol Sci 39(3):229-231. (2018)

5. Zeng, Xian;  Zhang, Peng;  He, Weidong;  Qin, Chu;  Chen, Shangying;  Tao, Lin;  Wang, Yali;  Tan, Ying;  Gao, Dan;  Wang, Bohua;  Chen, Zhe;  Chen, Weiping*;  Jiang, Yuyang*; Chen, Yuzong*, NPASS: natural product activity and species source database for natural product research, discovery and tool development. Nucleic Acids Research, 2018, 46 (D1), D1217-D1222.